9 мая 1858 заложен собор.
Сам преосвященный Иннокентий положил первый камень в фундамент собора.
Собор дал название городу.
После сообщения в СПб о закладке храма, 17/5 июля 1858 последовал указ Александра II об учреждении "в этом месте города ", станица Усть-Зейская переименована в город Благовещенск.
Строился на деньги Святейшего Синода (4000 руб.)
Престол освящён 2 апреля 1864, весь храм - 11 апреля 1864 высокопреосвященным Иннокентием.
4 июня 1891 "в час полудня на пароходе "Муравьев-Амурский" в Благовещенск прибыл цесаревич Николай Александрович (в последующем Николай II)"
"После торжественной встречи представителями общества, войсками и учебными заведениями на пристани у триумфальной арки Его Императорское Высочество в 15 мин. второго часа, при звоне колоколов, прибыл в Кафедральный Собор. На западном крае Собора Его Императорское Высочество был встречен Его Преосвященством (в полном облачении) и духовенством (12 чел.) и соблаговолил выслушать краткое сердечное приветствие Владыки...".
Затем Николай Александрович проследовал в собор и, "став на указанном Преосвященным месте перед иконою Пресвятой Богородицы "Слово плоть бысть", выслушал её краткую историю, после чего "цесаревич благоговейно преклонил колено перед сею иконою и набожно стал креститься".
Владыкою поднесена цесаревичу "приготовленная копия с сей ("Слово плоть бысть") иконы в серебряно-позолоченном с эмалью окладе с надписью на обратной стороне: "Его Императорскому Высочеству Государю Наследнику Цесаревичу Николаю Александровичу от градо-Благовещенского Собора 4 июня 1891г."
Приняв икону, Его Высочество, сопровождаемый Владыкою, направился ко входу..."
5 июня в 2 часа по полудни Его Императорское Высочество под звон колоколов "на пароходе отправился в дальнейший путь домой"...
В 1924 собор сгорел.
Спасённое имущество передано в церкви города.